導  讀

*學術期刊 《Cell》及其子刊公布了“癌癥和腫瘤基因圖譜”（TCGA）的“升級版”——泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結果，相關結果以二十幾篇高水平論文呈現，美國國家衛生研究院資助的科學家團隊完成大規模癌癥基因組圖譜繪制，他們根據基因變異和表達的相似性，提出可以按照分子類型給癌癥進行“歸類”。研究人員認為，這將為癌癥診斷和治療提供新思路。

早在十幾年前就已開始的一項大規模研究工作 “PanCancer Atlas” 近日已全面完成，它為研究人員和臨床醫生提供了一種根據其基因組和分子特征全面了解癌癥的新方法。

PanCancer Atlas范圍非常廣，涵蓋了*學術期刊《Cell》及其子刊所發表的二十多篇科學論文。它代表癌癥基因組圖譜（TCGA）工作中的一個巨大里程碑。癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA）早已為*廣為知曉，這項計劃于2005年提出，旨在通過基因組學分析技術，將人類全部癌癥的基因組變異圖譜繪制出來，從而更好地了解癌癥發生和發展的機制。

該項目由國立衛生研究院（NIH）的兩個研究機構同時贊助，即國家癌癥研究所（NCI）和國家人類基因組研究所。

全美超過二十多個研究機構的150多位研究人員參與了這項耗資3億美元的項目。“這個項目，是十多年開創性工作的結晶。”美國國立衛生研究院院長弗朗西斯科林斯博士說。

從不同的角度看癌癥

癌癥是一種疾病，當細胞由于其DNA的錯誤編碼開始失控時，就會出現這種疾病。傳統的癌癥分類方法是根據它在體內的起始位置 - 如乳腺癌，前列腺癌或胃癌。

PanCancer Atlas的這項工作是2012年在加利福尼亞圣克魯斯舉行的一次會議上由Pan-Cancer Initiative發起的。

那時，科學家們已經注意到一些關于癌癥的有趣特征，使他們對疾病分類的傳統方式產生質疑。一個有趣的特征是，盡管癌細胞開始于身體的不同部位，但有一些癌癥在分子水平上是相似的。另一個有趣的特征是，在同一組織中開始的癌癥在分子水平上可能非常不同，具有不同的“基因組譜”。

對研究人員&臨床醫生的影響

這些早期的分子形態促使研究人員調查每種癌癥基因組中的變化——DNA的完整組合——可能會驅動某種疾病。

PanCancer Atlas是努力調查后的結果，將為改善各類癌癥的預防，檢測和治療鋪平道路。

正如Pan-Cancer Initiative協辦方Josh Stuart--加州大學圣克魯斯分校生物分子工程教授所說：“了解一種癌癥如何與另一種形式的疾病相關，可能具有真正的臨床意義。”他也認為，”在某些情況下，我們可以借鑒已知疾病的臨床實踐，并將其應用于治療方案不明確的癌癥。“

從分子角度看，癌癥也為已被批準用于其他具有癌癥分子特征的疾病的藥物開辟了道路。其中一個例子是在類風濕性關節炎中被激活的JAK / Stat分子途徑。研究人員發現，這個通路在一些新認定的腫瘤組中上調。

PanCancer Atlas論文

三個PanCancer Atlas論文集中的每一個都是由熱點或綜述和論文引入的。在門戶的登錄頁上有明確的鏈接和相關文章。

*篇綜述介紹了“cell-of-origin patterns”這一類別，概述了研究人員如何通過基因表達，染色體異常和DNA改變使“molecular clustering”形成腫瘤群。它表明這些發現將使不同類型的癌癥得到更具體的治療。

第二篇綜述介紹了“oncogenic processes” 種類，并認為這些發現將有助于研究人員確定他們應該選擇哪些免疫療法和相應治療方案的優先順序。

除了給出一個廣泛的總結，該論文還描述了癌癥發展中三個關鍵過程的鑒定：①遺傳和獲得性突變; ②腫瘤基因組和表觀基因組如何影響基因和蛋白質的表達; ③腫瘤細胞與免疫系統之間的相互作用。

第三篇綜述整理了“signaling pathways”的類型，并總結了調節細胞周期，細胞生長和細胞死亡的信號通路中基因組改變的發現。這篇論文強調了這些過程對于不同癌癥的相似性和差異性，并表明這些發現將有助于個性化用藥，還可以在聯合治療中開發新的治療方法。

“這個項目為癌癥研究人員提供了人類的途徑去了解腫瘤發生，發展以及從何而來等重要信息，從而優化臨床試驗和未來的治療方案。”

                                     ——弗朗西斯科林斯博士

參考文獻

Catharine Paddock et.al Why does cancer arise? Landmark study provides unique insight. (2018)